每一輪的親和選擇包括原始的或富集的gⅥ—cDNA文庫中噬菌粒顆粒的獲取和純化以及它們自身的淘選過程。介紹兩種不同的方法來抽提特異的噬菌體。
1噬菌體文庫的獲取和純化
在每輪淘選循環(huán)中的起始部分,(富集的)Topl0F,
細胞經(jīng)輔助噬菌體被雙重感染以便產(chǎn)生和純化gⅥ—cDNAt噬菌粒顆粒,從而進行下一輪的淘選。在淘選過程中,如果沒有特異的緩沖液且噬菌體對誘餌的親和力較高(如
免疫親和篩選),此時經(jīng)雙重感染獲得的噬菌體顆粒并不一定要純化。
2生物素化的誘餌的制備
用不同的配體標準化淘選的一個方法是用普通的標記物(如生物素)來標記誘餌,或使用鏈霉親和素包被的酶聯(lián)免疫吸附實驗(ELISA)的平板孔或小珠來淘選。兩個有效的(氨基反應的)生物素化試劑是二硫化N—羥基丁二酰亞胺生物素酯(biotin disulfide N—hydrox—ysuccinimideester)和生物素化氨基己酸—N—羥基丁二酰亞胺(biotinamidocaproate N—hydroxysuccinimide)(Sigma)。與后者試劑相比,前者在生物素和誘餌之間有一個可切斷的二硫鍵,它是在生物淘選過程中特異抽提(用50mmol/L二硫蘇糖醇)噬菌體的試劑,整個生物素的水平可用HABA方法來評估。
3用生物素化的誘餌的淘選過程
在用生物素化的誘餌來親和純化gⅥ—cDNA噬菌體顆粒的標準過程中,用鏈霉親和素包被的磁珠預處理噬菌粒文庫,以便首先除去與鏈霉素非特異結(jié)合的噬菌體顆粒。在第三輪淘選后,個別克隆可用ELISA來分析或進行額外的淘選過程。然而,必須注意到成功的展示要求pⅥ融合蛋白定位在外周胞質(zhì)上,正確地折疊并組合成完整的噬菌體顆粒。這樣的話,如果表達pⅥ融合蛋白的結(jié)合者干擾了選擇過程,那么將會稀釋“非干擾”結(jié)合者的濃度。
4免疫親和淘選過程
用抗血清來分離gⅥ—cDNA噬菌體顆粒,而且所需要的抗血清是微量的(微升數(shù)量的)。